Logo merepresentasikan semangat dan dinamika baru UIN Antasari Banjarmasin. Konsep visual logo UIN Antasari didasarkan atas visi dan misi. Logo merupakan penggambaran “sungai pengetahuan” yang dibangun melalui perpaduan 5 unsur desain: kubah, aliran sungai, pena, partikel atom dan bola dunia dengan makna filosofis sebagai berikut:
Kubah, 
melambangkan keluasan, kelapangan, serta keterbukaan UIN Antasari beserta segenap civitas academicanya dalam menyelenggarakan pendidikan keislaman yang unggul kompetitif dan berakhlak;
Aliran Sungai, 
menandakan keberadaan UIN Antasari yang terletak di Banjarmasin yang memiliki banyak sungai dan dikenal sebagai kota seribu sungai;
Pena, 
aliran sungai yang bertransformasi menjadi bentuk pena menggambarkan upaya dan konsistensi UIN Antasari untuk mengalirkan dan mengajarkan ilmu pengetahuan yang bermanfaat bagi nusa dan bangsa. Sebuah sungai pengetahuan;
Partikel Atom, 
melambangkan ilmu pengetahuan. UIN Antasari sebagai universitas masa depan yang selalu mengembangkan, melakukan riset dan berinovasi serta mengeksplorasi ilmu pengetahuan;
Bola Dunia,
melambangkan globalisasi. Bola dunia yang berada di tengah melambangkan fokus UIN Antasari dalam mensukseskan visi dan misinya untuk ikuit berperan aktif mengembangkan ilmu pengetahuan yang berwawasan global.
Warna
Warna Hijau, 
mencitrakan nuansa islami. Pilihan warna ini untuk mencitrakan UIN Antasari Banjarmasin menyelenggaran pendidikan ilmu-ilmu keislaman;
Warna Kuning Keemasan, mencitrakan keunggulan pendidikan di UIN Antasari;

Warna Biru, mencitrakan kejernihan berpikir, keluasan visi dan pandangan serta kejelasan arah tujuan UIN Antasari.